Periodo de la administración española (1722-1898)
Puerto Rico comparte su patrimonio documental con España, ya que gran parte de los documentos de la época temprana de la conquista y colonización (siglos XVI y XVII) se encuentran en los archivos españoles. En Puerto Rico, los documentos existentes de este periodo datan a partir del siglo XVIII. Entrelos fondos documentales más destacados en el archivo se encuentran: Capitanía General de Puerto Rico, la Real Hacienda, la Real Audiencia, Obras Públicas, los documentos municipales y los protocolos notariales. Algunas de estas dependencias del gobierno peninsular cesaron de operar a partir del Tratado de París, firmado por Estados Unidos y España al concluir la Guerra Hispanoamericana.
